大肠埃希氏菌检测技术综述
大肠埃希氏菌作为粪便污染的指示菌和某些致病型(如肠致病性、产志贺毒素、肠出血性等)的病原体,其检测在食品安全、饮用水卫生、临床诊断及环境监测等领域具有至关重要的意义。一套完整的检测流程通常包括定性、定量、确认及分型等多个层面。
检测项目主要分为两大类:作为指示菌的总大肠菌群/耐热大肠菌群(粪大肠菌群),以及作为病原体的致病性大肠埃希氏菌。其检测原理各异。
1.1 指示菌检测
多管发酵法:经典方法。基于目标菌的生化特性,在含乳糖的培养基中,大肠菌群能发酵乳糖产酸产气。通过最可能数(MPN)统计,估算样品中菌落形成单位(CFU)的浓度。耐热大肠菌群(粪大肠菌群)检测需在44.5℃下进行二次发酵。
滤膜法:适用于水样等杂质较少的液体。样品通过滤膜过滤,细菌被截留,将滤膜置于选择性琼脂培养基上培养,计数典型菌落(如带金属光泽的菌落)。
酶底物法:现代常用方法。利用大肠菌群特有的β-半乳糖苷酶分解邻硝基苯-β-D-半乳吡喃糖苷(ONPG)产生黄色,以及大肠埃希氏菌的β-葡萄糖醛酸酶分解4-甲基伞形酮-β-D-葡萄糖醛酸苷(MUG)产生荧光的原理。通过颜色或荧光变化进行定性与定量(MPN法或计数法)。
定义性琼脂平板法:如结晶紫中性红胆盐琼脂(VRBA)。样品涂布或倾注后培养,计数红色或紫色、有沉淀环的典型菌落。
1.2 致病性大肠埃希氏菌检测
生化与血清学分型:传统方法。经分离纯化后,通过吲哚、MR-VP、柠檬酸盐利用等生化试验初步鉴定,再用针对O抗原(菌体)和H抗原(鞭毛)的特异性抗血清进行凝集试验,确定血清型(如O157:H7)。
分子生物学检测:
聚合酶链式反应(PCR)及实时荧光定量PCR(qPCR):针对致病性大肠埃希氏菌的特异性毒力基因(如stx1/stx2志贺毒素基因、eae紧密素基因、aggR聚集性黏附基因等)设计引物与探针。通过扩增特定核酸片段实现快速、高灵敏度的定性或定量检测,常用于筛查和确认。
基因芯片与测序技术:通过高通量检测多个毒力基因或全基因组测序(WGS),实现精准分型、溯源分析和毒力特征评估,是疫情调查和前沿研究的核心工具。
免疫学检测:
酶联免疫吸附试验(ELISA):利用特异性抗体捕获样品(如增菌液或分离株)中的菌体抗原或毒素(如志贺毒素),通过酶标二抗与底物反应进行显色判定。
免疫磁珠分离技术(IMS):将针对特定O抗原(如O157)的抗体偶联至磁珠,与样品混合后,目标菌被抗体捕获,通过磁场分离富集,大幅提高后续培养或检测的灵敏度。
食品安全:生食果蔬、肉类(尤其是牛肉)、乳制品、水产品、即食食品等。重点监测O157:H7等产志贺毒素大肠埃希氏菌(STEC)以及其他致泻性大肠埃希氏菌。
饮用水与包装饮用水:监测总大肠菌群、耐热大肠菌群和大肠埃希氏菌作为粪便污染与处理效率的核心指标,是各国饮用水标准的法定项目。
临床医学:对腹泻患者粪便样本进行致病性大肠埃希氏菌的分离鉴定与分型,指导治疗和流行病学调查。
环境监测:地表水、地下水、海水浴场水质、土壤及污水排放口的粪便污染指示菌监测,评估环境卫生状况。
药品与化妆品:部分药典和规范要求对非无菌制剂和原料进行大肠埃希氏菌检查,作为特定微生物控制指标。
一个完整的检测通常遵循“初筛-分离-确认-分型”的流程。
样品处理与增菌:无菌取样,按规定制备匀液。通常使用缓冲蛋白胨水或选择性增菌液(如EC肉汤、mTSB等)进行非选择性或选择性增菌,使目标菌复苏、增殖。
初筛与分离:
指示菌:直接接种酶底物试剂或发酵管,或过滤、涂布选择性平板。
致病菌(如O157):常使用IMS富集后,划线接种对目标菌有选择性和鉴别性的琼脂平板(如山梨醇麦康凯琼脂SMAC、显色琼脂等)。
菌落鉴定与纯化:挑取典型或可疑菌落(如SMAC上不发酵山梨醇的无色菌落、显色琼脂上特定颜色菌落),进行纯培养。
确认试验:
生化确认:进行吲哚试验、MUG试验、氧化酶试验等。
免疫学或快速生化确认:使用乳胶凝集试剂盒检测O157抗原等。
毒力基因检测与分型:对生化确认的菌株,提取核酸,采用PCR/qPCR检测关键毒力基因。必要时进行血清学分型或全基因组测序。
微生物培养与分离设备:
恒温培养箱/振荡培养箱:提供准确、稳定的培养温度(如36±1℃,44.5℃),后者同时提供振荡以利于液体培养基中菌体的均匀生长与气体交换。
生物安全柜:提供无菌操作环境,保护操作人员、样品和环境,是所有活菌操作的关键设备。
自动菌落计数仪/全自动菌落分析系统:通过图像识别技术对琼脂平板上的菌落进行自动计数、测量和初步分类,提高计数效率和准确性。
分子生物学检测仪器:
聚合酶链式反应(PCR)仪/实时荧光定量PCR仪:核心核酸扩增设备。后者能实时监测扩增过程,实现定量检测,并具备更高的特异性和自动化程度。
核酸提取仪:自动化完成细胞裂解、核酸结合、洗涤与洗脱步骤,实现高质量核酸的快速、批量提取。
电泳系统:用于常规PCR产物的分离与鉴定。
全基因组测序平台:用于病原体的高分辨率分型、溯源和耐药基因、毒力基因分析。
免疫学与辅助设备:
酶标仪:读取ELISA等微孔板实验的吸光度或荧光值,进行定量或定性分析。
磁力架/磁珠处理器:用于免疫磁珠分离(IMS)过程中的磁珠富集与清洗。
微生物质谱鉴定系统:基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术,通过检测菌体蛋白质指纹图谱快速、准确鉴定纯培养的微生物至种水平。
样品前处理设备:
均质器/拍击式均质器:将固体样品与稀释液充分均质,制成均匀的检测样液。
天平、移液器、涡旋混合器:基础但至关重要的实验室设备,确保样品称量、加样和混匀的精确性。
综上所述,大肠埃希氏菌的检测已形成由传统培养法、免疫学方法及现代分子生物学技术构成的多元化技术体系。各方法相互补充,在实际应用中需根据检测目的、样品类型、通量需求、时效性和技术条件进行合理选择和组合,以确保检测结果的准确性、灵敏度与时效性。